GFP（緑色蛍光タンパク質）を用いたウイルス研究
2016年から2020年の間に発表された、GFPタンパク質とクロモテックのGFP-Trap®を使用したウイルス研究の文献を紹介します。
公開文献の抜粋（2016年～2020年）
本稿では、2016年から2020年の4年間に発表された、ウイルスを研究対象として緑色蛍光タンパク質（GFP：Green fluorescent protein）を用いた論文を紹介します。多くの論文は、ウイルスタンパク質が結合する宿主細胞のパートナータンパク質を同定するために、GFP融合タンパク質に対して免疫沈降（IP：Immunoprecipitation）や共免疫沈降（Co-IP：Co-immunoprecipitation）を実施したことを報告しています。その他の論文では、質量分析（MS：Mass spectrometry）法による解析や機能アッセイの実施について報告しています。
コロナウイルス（COVID-19の原因となる新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）とは異なる、過去のコロナウイルス株）に関する基礎研究には、クロモテック（2020年よりプロテインテックの一部）の「Nano-Trap（ナノトラップ）」シリーズの大ヒット商品であるGFP-Trap®が使用されています。
- p53 down-regulates SARS coronavirus replication and is targeted by the SARS-unique domain and PLpro via E3 ubiquitin ligase RCHY1. Y. Ma-Lauer, J. Carbajo-Lozoya, M. Y. Hein, M. A. Muller, W. Deng, J. Lei, B. Meyer, Y. Kusov, B. von Brunn, D. R. Bairad, S. Hunten, C. Drosten, H. Hermeking, H. Leonhardt, M. Mann, R. Hilgenfeld, A. von Brunn; Proceedings of the National Academy of Sciences 2016, 113 (35), E5192-E5201 (PubMed ID 27519799)
- Tubulins interact with porcine and human S proteins of the genus Alphacoronavirus and support successful assembly and release of infectious viral particles. T. Rudiger, P. Mayrhofer, Y. Ma-Lauer, G. Pohlentz, J. Muthing, A. von Brunn, C. Schwegmann-Wessels; Virology 2016, 497, 185-1972016 (PubMed ID 27479465)
- The cellular interactome of the coronavirus infectious bronchitis virus nucleocapsid protein and functional implications for virus biology. E. Emmott, D. Munday, E. Bickerton, P. Britton, M. A. Rodgers, A. Whitehouse, E. M. Zhou, J. A. Hiscox; Journal of Virology 2013, 87 (17), 9486-9500 (PubMed ID 23637410)
以下の表には、GFP-Trap®が使用されているウイルス研究論文をまとめました。
|
ウイルス |
科 |
属 |
アプリケーション |
PubMed ID / リンク |
発表（年） |
|
Abutilon mosaic virus（AbMV） |
Geminiviridae |
Begomovirus |
Co-IP、MS |
2017 |
|
|
Adenovirus |
Adenoviridae |
- |
Co-IP、MS |
2016 |
|
|
Alphacoronavirus |
Coronaviridae |
Alphacoronavirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Cauliflower mosaic virus |
Caulimoviridae |
Caulimovirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Chikungunya virus（CHIKV） |
Togaviridae |
Alphavirus |
Co-IP、MS |
2018 |
|
|
Chikungunya virus（CHIKV） |
Togaviridae |
Alphavirus |
IP、functional assay |
2020 |
|
|
Chikungunya virus（CHIKV） |
Togaviridae |
Alphavirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Citrus psorosis virus（CPsV） |
Aspiviridae |
Ophiovirus |
Co-IP |
2018 |
|
|
Cotton leaf curl Multan virus（CLCuMuV） |
Geminiviridae |
Begomovirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Cotton leaf curl Multan virus（CLCuMuV） |
Geminiviridae |
Begomovirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Dengue virus（DENV） |
Flaviviridae |
Flavivirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Dengue virus（DENV） |
Flaviviridae |
Flavivirus |
Co-IP、MS |
2019 |
|
|
Ebola virus（EBOV） |
Filoviridae |
Ebolavirus |
Co-IP |
2018 |
|
|
Ebola virus（EBOV） |
Filoviridae |
Ebolavirus |
Co-IP、MS |
2016 |
|
|
Enterovirus |
Picornaviridae |
Enterovirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Guinea pig cytomegalovirus（GPCMV） |
Betaherpesvirinae |
Cytomegalovirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Guinea pig cytomegalovirus（GPCMV） |
Betaherpesvirinae |
Cytomegalovirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Hendra virus V（HeV） |
Paramyxoviridae |
Henipavirus |
Co-IP |
2018 |
|
|
Hepatitis C virus（HCV） |
Flaviviridae |
Hepacivirus |
IP |
2018 |
|
|
Herpes simplex virus（HSV） |
Herpesviridae |
Simplexvirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Herpes simplex virus type 1（HSV-1） |
Herpesviridae |
Simplexvirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Herpes simplex virus type 1（HSV-1） |
Herpesviridae |
Simplexvirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Herpes simplex virus type 1（HSV-1） |
Herpesviridae |
Simplexvirus |
Co-IP、MS |
2019 |
|
|
Herpes simplex virus type 1（HSV-1） |
Herpesviridae |
Simplexvirus |
Co-IP、RIP |
2017 |
|
|
Herpes simplex virus type 2（HSV-2） |
Herpesviridae |
Simplexvirus |
Co-IP |
2018 |
|
|
Human cytomegalovirus（HCMV） |
Betaherpesvirinae |
Cytomegalovirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Human immunodeficiency virus（HIV） |
Orthoretrovirinae |
Lentivirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Human immunodeficiency virus 1（HIV-1） |
Orthoretrovirinae |
Lentivirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Human immunodeficiency virus 1（HIV-1） |
Orthoretrovirinae |
Lentivirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Human immunodeficiency virus 1（HIV-1） |
Orthoretrovirinae |
Lentivirus |
Co-IP |
2020 |
|
|
Human noroviruses（HuNoV） |
Caliciviridae |
Norovirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Human papillomavirus（HPV） |
Papillomaviridae |
- |
IP |
2017 |
|
|
Infectious bronchitis virus（IBV） |
Coronaviridae |
Gammacoronavirus |
Co-IP、MS |
2013 |
|
|
Influenza A virus |
Orthomyxoviridae |
Alphainfluenzavirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Influenza A virus |
Orthomyxoviridae |
Alphainfluenzavirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Kallithea virus（KV） |
Nudiviridae |
Alphanudivirus |
Co-IP、MS |
2019 |
|
|
Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus（KSHV） |
Herpesviridae |
Rhadinovirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus（KSHV） |
Herpesviridae |
Rhadinovirus |
Co-IP、MS |
2016 |
|
|
Merkel cell polyomavirus（MCPyV） |
Polyomaviridae |
Alphapolyomavirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Nipah virus（NiV） |
Paramyxoviridae |
Henipavirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Plum Pox Virus |
Potyviridae |
Potyvirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus（PRRSV） |
Arteriviridae |
Porartevirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus（PRRSV） |
Arteriviridae |
Porartevirus |
IP |
2016 |
|
|
Pseudorabies Virus |
Herpesviridae |
Varicellovirus |
ChIP |
2017 |
|
|
Rabies virus（RABV） |
Rhabdoviridae |
Lyssavirus |
Co-IP、AP-MS |
2017 |
|
|
Rabies virus（RABV） |
Rhabdoviridae |
Lyssavirus |
Co-IP |
2016 |
|
|
Red clover necrotic mosaic virus（RCNMV） |
Tombusviridae |
Dianthovirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Reptilian orthoreovirus |
Reoviridae |
Orthoreovirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Severe acute respiratory syndrome coronavirus（SARS-CoV） |
Coronaviridae |
Betacoronavirus |
Co-IP、ubiquitination/deubiquitination assay、kinase assay |
2016 |
|
|
Tick-borne encephalitis virus |
Flaviviridae |
Flavivirus |
Co-IP |
2019 |
|
|
Tobacco vein banding mosaic virus（TVBMV） |
Potyviridae |
Potyvirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Tomato yellow leaf curl virus（TYLCV） |
Geminiviridae |
Begomovirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Tomato yellow leaf curl virus（TYLCV） |
Geminiviridae |
Begomovirus |
Co-IP |
2020 |
|
|
Turnip mosaic virus（TuMV） |
Potyviridae |
Potyvirus |
Co-IP |
2018 |
|
|
Turnip mosaic virus（TuMV） |
Potyviridae |
Potyvirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Vaccinia virus（VacV） |
Poxviridae |
Orthopoxvirus |
Co-IP |
2017 |
|
|
Varicella zoster virus |
Herpesviridae |
Varicellovirus |
Co-IP |
2020 |
GFP-Trap®を使用した論文は2015年以前にも発表されていますが、本ブログには掲載していません。GFP-Trap®を使用している、その他の論文については製品ページの論文使用実績（Publications）をご覧ください。
プロテインテックのGFP-Trap®は、GFPタグ融合タンパク質の免疫沈降用の多目的に利用可能なツールです。GFP-Trap®は、免疫沈降用ビーズに共有結合した抗VHH抗体（別名：Nanobody®）からなる製品です。GFP-Trap®とその関連製品については、こちら（製品検索）をご覧ください。
抗GFP VHH抗体（別名：Nanobody®）は、GFPタンパク質と極めて安定的に相互作用し、効率的なGFPタグ融合タンパク質の免疫沈降に使用できます。優れた相互作用によって、数多くの異なる免疫沈降条件やプロトコールで調製される様々な生物種由来の細胞ライセートから目的のタンパク質を回収することができます。GFP-Trap®は高い親和性を有し、バックグラウンドの低い結果を得ることができるため、存在量の少ないGFPタグ融合タンパク質も効率的にプルダウンできます。
プロテインテックでは、GFP-Trap®のサンプルを無償で提供しています。下記フォームよりご依頼ください。
（※ 国内におけるプロテインテック製品の出荷および販売は、コスモ・バイオ株式会社を通じて行っております。
最寄りのコスモ・バイオ株式会社 代理店をご指定の上、ご依頼ください。）
